Les cyanobactéries de ce taxon se reproduisent soit exclusivement, soit à certains stades, par la formation de petites cellules sphériques (baeocytes). La cellule parentale grossit, sa membrane externe s'épaissit et finit par libérer de 4 à plus de 1 000 baeocytes. La division multiple est la caractéristique phénotypique qui distingue ce sous-groupe des toutes les autres cyanobactéries.

I. Reproduction seulement par division multiple (sous-groupe 1)

A. Cellule végétative avec une polarité base apex (piriforme ou ovoïde)

1. Baeocytes immobiles avec paroi fibreuse à la libération -> Cyanocystis

2. Baeocytes sans paroi fibreuse à la libération, parfois mobiles-> Dermocarpella

B. Cellule végétative sans polarité (sphérique); jusqu'à 1 000 baeocytes

1. Baeocytes sans paroi fibreuse à la libération, mobiles ou non -> Stanieria

2. Baeocytes avec paroi fibreuse à la libération, immobiles -> Xenococcus

II. Reproduction par nombreuses divisions binaires suivies de divisions multiples (sous-groupe 2)

A. Les cellules végétatives se reproduisent par divisions binaires dans trois plans formant des amas cubiques ou irréguliers. Elles forment ensuite des baeocytes par divisions multiples

1. Baeocytes immobiles avec paroi fibreuse à la libération -> Chroococcidiopsis

2. Baeocytes sans paroi fibreuse à la libération, mobiles ou non-> Myxosarcina

B. Divisions binaires dans plusieurs plans produisant des agrégats irréguliers avec ou sans pseudofilaments résultant dedivisions intermittentes dans un seul plan. Seulement quelques cellules forment des baeocytes qui sont souvent mobiles--> Pleurocapsa group