Taxonomie des Procaryotes
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Thermodesulfobacteria: Phylum BIII du Domaine Bacteria
  CI. Methanobacteria
CII. Methanococci
CIII. Methanomicrobia
  CIV. Halobacteria
CV. Thermoplasmata
CVI. Thermococci
CVII. Archaeoglobi
CVIII. Methanopyri
CIX. Nanoarchaeota
AIV. Nanoarchaeota
AV. Thaumarchaeota
 
   
   
   
   
    OVI. Rhizobiales
    OVII. Kordiimonadales,
OVIII. Parvulaculales
OIX. Sneathiellales
  CII. Beta-Proteobacteria
   
   
 
   
    OIII. Xanthomonadales
OIV.Cardiobacteriales
   
   
   
   
   
 
   
   
    OIV.Desulfomonadales
OV.Desulfarcales
   
   
 
   
   
  CVI. Zeta-Proteobacteria
 
    OI_1. Clostridiales
    OI_2. Clostridiales
    OII. Thermanaero-bacteriales
    OIII.Halanaerobiales
OIV.Natranaerobiales
  CII. Negativicutes
 
    OI. Bacillales
    OII. Lactobacillales
  CIV. Thermolithobacteria
  CV. Erysipelotrichi
  SCI. Acidimicrobidae
SCII. Rubrobacteridae
SCIII. Coriobacteridae
  SCIV. Actinobacteridae
SOI. Actinomycinae
SOII. Micrococcinae
  SOVII.Corynebacterinae
SOVIII.Micromonosporinae
  SOIX. Propionibacterinae
SOX. Pseudocardinae
  SOXI. Streptomycinae
SOXII.Streptosporanginae
  SOXIII. Frankinae
SOXIV. Glyomicinae
SOXV. Catelunisporinae
  OII. Bifidobacteriales
SCV. Nitriliruptoridae
 
 
 
 
BXXVIII. Caldiserica
BXXIX. Elusimicrobia
BXXX. Armatimonadetes
   

















1. Propriétés du Phylum

Fonctions: fermentaires, sulfato- et thiosulfato-réducteurs
Morphologie: bâtonnets
Croissance: anaérobies stricts, thermophiles
Nutrition: chimioorganotrophes
Habitat: environnement chauds

2. Taxonomie

Phylum BIII. Thermodesulfobacteria

Classe I. Thermodesulfobacteria

Ordre I. Thermodesulfobacteriales

Famille I. Thermodesulfobacteriaceae : Thermodesulfobacterium, Caldimicrobium, Geothermobacterium, Thermodesulfatator

3. Description des Genres

Thermodesulfobacterium

Bâtonnets (0,3 x 2 microns) isolés, en paires ou en chaînes, non mobiles ou mobiles par un flagelle polaire, non sporulés, excroissances latérales ou terminales, inclusions cytoplasmiques. Gram négatif. Oxydent incomplètement le lactate, le pyruvate, le formate et H2+CO2 en acétate. Accepteurs d'électrons : sulfate, sulfite, thiosulfate. Fermentation du pyruvate et limitée du lactate en acétate + H2 + CO2. Les cellules renferment le cytochrome c3 et une bisulfite réductase, la desulfofuscidine. Prototrophe. Croissance optimale à 65-70°C (45-85°C), pH 6,8-7,3 (6-8,3) et NaCl 0-20 g/l. Temps de division, 4 h. ADN : 34 mol % de G+C. Quatre espèces, dont Thermodesulfobacterium commune isolée d’un sédiment anaérobie d’une source thermale du parc de Yellowstone aux E.U.

Caldimicrobium (L. caldus, chaud ; L. microbium, microbe)

Bâtonnets ovales (0,5 x 1,0-1,2 microns), mobiles par 2 flagelles polaires, non sporulés, Gram négatif. Anaérobies stricts, croissance chimiolithoautotrophe sur H2+CO2 et thiosulfate ou soufre élémentaire. Chimio-organotrophes sur éthanol, fumarate, succinate ou malate en présence de thiosulfate. Prototrophes. Thermophile extrême, Croissance optimale à 75°C (52-82°C) et pH 7,0-7,2 (6,8-7,4). ADN : 35,2 mol % G+C. Une seule espèce isolée d’une source chaude du kamchatka, Caldimicrobium rimae.

Geothermobacterium

Bâtonnets, 0,5 x 1,0-1,2 microns, isolés ou en paires, mobiles par un flagelle polaire, Gram négatif. Anaérobies stricts chimio-autotrophes couplant l’oxydation de l’hydrogène à la réduction de l’oxyde de Fe(III) faiblement cristallin comme seul accepteur d’électrons. Croissance inhibée par chloramphénicol, puromycine, rifampicine, érythromycine, kanamycine, phosphomycine, vancomycine-HCl et Trimethoprim. Croissance optimale entre 85-90°C à pH 6,8-7,0. Pas de croissance à 58 ou 102°C. Tolèrent jusqu’à 7,5 g/l de NaCl avec un optimum de 0-0,5 g/l. Une seule espèce isolée de sources chaudes du parc de Yellowstone aux USA, Geothermobacterium ferrireducens.

Thermodesulfatator (L. desulfatator, sulfato-réducteur)

Bâtonnets (0,4-0,5 x 0,8-1 microns), isolés, en paires ou courtes chaînes de trois cellules, mobiles par un flagelle polaire, non sporulés, Gram négatif. Anaérobies chimio-lithoautotrophes stricts utilisant le sulfate comme accepteur d’électrons et H2 comme donneur d’électrons. Absence de métabolisme fermentaire. La croissance est stimulée par quelques alcools et acides organiques. L’ammonium est la source préférée d’azote. Sensibles à l’ampicilline, au chloramphénicol et à la rifampicine ; résistants à la tétracycline, la streptomycine, la pénicilline et la kanamycine. La lipoquinone majeure est la MK-7. Lipides polaires prédominants: phosphatidyléthanolamine et phosphatidylinositol. Croissance optimale à 70°C (55-80°C), pH 6,25 (6-6,7) et 25 g/l de NaCl (10-35 g/l). ADN : x mol % G+C. Deux espèces isolées de cheminées hydrothermales profondes dont Thermodesulfatator indicus.

 

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